More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0109 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 513 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  87.22 
 
 		 527 aa  864    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  54.84 
 
 		 501 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 508 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  48.7 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  50.6 
 
 		 509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  47.86 
 
 		 509 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 496 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  42.01 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 486 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 490 aa  365  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  40.98 
 
 		 488 aa  344  2e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.5 
 
 		 494 aa  342  7e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 495 aa  333  5e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 499 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 488 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  40.42 
 
 		 491 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 497 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 489 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.23 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.36 
 
 		 488 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  30.94 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  32.28 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 509 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 517 aa  203  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 504 aa  197  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 477 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 508 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 494 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  31.56 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.19 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 		 491 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 488 aa  190  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 574 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 490 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 473 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 495 aa  186  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.8 
 
 		 485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.79 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 492 aa  183  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 500 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  26.96 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 504 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 470 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.47 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 463 aa  181  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  36.64 
 
 		 493 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 537 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 502 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.96 
 
 		 515 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  36.27 
 
 		 570 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.25 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 493 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  29.12 
 
 		 471 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 513 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 515 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.8 
 
 		 472 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 477 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.75 
 
 		 507 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 492 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.59 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 499 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>