More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4441 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
490 aa  991    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  77.66 
 
 
489 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  92.24 
 
 
490 aa  898    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  64.54 
 
 
494 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  64.54 
 
 
494 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  64.33 
 
 
494 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  64.07 
 
 
509 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  64.12 
 
 
494 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  64.07 
 
 
494 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  63.58 
 
 
495 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.76 
 
 
485 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  61.4 
 
 
504 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  61.55 
 
 
485 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  61.87 
 
 
574 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  61.91 
 
 
493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  62.12 
 
 
493 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  61.91 
 
 
570 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  58.9 
 
 
504 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  54.41 
 
 
473 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  53.18 
 
 
476 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
475 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
478 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
477 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  47.76 
 
 
502 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
498 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
491 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.49 
 
 
488 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.24 
 
 
488 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
488 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
477 aa  319  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
490 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
496 aa  299  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.75 
 
 
508 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.1 
 
 
497 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
509 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
492 aa  279  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 
472 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  35.29 
 
 
475 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.7 
 
 
496 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
509 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.2 
 
 
497 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.61 
 
 
509 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
496 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  34.86 
 
 
520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.54 
 
 
499 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
503 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
492 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
488 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  37.47 
 
 
516 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 
520 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
569 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.97 
 
 
472 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  38.75 
 
 
492 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  37.65 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.92 
 
 
506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.02 
 
 
499 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.03 
 
 
496 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
516 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.2 
 
 
495 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
487 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.13 
 
 
507 aa  266  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.59 
 
 
503 aa  266  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  36.9 
 
 
510 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.63 
 
 
504 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.23 
 
 
476 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
495 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  34.02 
 
 
504 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  38.13 
 
 
502 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.63 
 
 
515 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 
495 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.33 
 
 
500 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  32.71 
 
 
467 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  35.83 
 
 
490 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.91 
 
 
502 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  32.98 
 
 
485 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
503 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.9 
 
 
501 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.63 
 
 
523 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.97 
 
 
503 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
492 aa  261  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
502 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 
502 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  35.7 
 
 
502 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
502 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
502 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.14 
 
 
485 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
501 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
501 aa  259  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
485 aa  259  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  35.11 
 
 
499 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
506 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
506 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
509 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
501 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>