More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0345 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
470 aa  967    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 
480 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  38.14 
 
 
477 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
496 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.18 
 
 
470 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  34.16 
 
 
508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  33.81 
 
 
509 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
492 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
490 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 
472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
509 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
507 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.4 
 
 
507 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
507 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 
507 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  33.4 
 
 
507 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.79 
 
 
488 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.41 
 
 
488 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.06 
 
 
511 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  34.76 
 
 
523 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
506 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
484 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
488 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
506 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
513 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
506 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
490 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
509 aa  296  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
506 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  34.46 
 
 
510 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.52 
 
 
515 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
501 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
506 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
506 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  33.4 
 
 
509 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.75 
 
 
485 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.96 
 
 
485 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
503 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  34.26 
 
 
502 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.9 
 
 
503 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.04 
 
 
502 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
502 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
502 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
502 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
485 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  32.06 
 
 
520 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.19 
 
 
485 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
475 aa  286  8e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  31.63 
 
 
521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1082  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.029023  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  34.92 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 
520 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
501 aa  282  9e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
485 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.39 
 
 
507 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.24 
 
 
504 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.98 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
501 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
501 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
485 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 
501 aa  280  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
569 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
494 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
494 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.99 
 
 
465 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  35.28 
 
 
470 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.64 
 
 
500 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
475 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 
504 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
492 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
463 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  31.98 
 
 
494 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
487 aa  276  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  34.04 
 
 
490 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
491 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  33.26 
 
 
520 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.78 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
493 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  31.91 
 
 
495 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.26 
 
 
471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.26 
 
 
476 aa  273  5.000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  33.76 
 
 
463 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
494 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 
492 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.16 
 
 
509 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000554  transcriptional regulator GntR family/aminotransferase class-i  34.43 
 
 
481 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  34.24 
 
 
488 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  31.97 
 
 
492 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
466 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  32.14 
 
 
516 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
516 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
492 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
504 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
493 aa  270  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>