More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3752 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  62.55 
 
 		 508 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 513 aa  1040    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  61.3 
 
 		 508 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  61.23 
 
 		 509 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 508 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  60.2 
 
 		 509 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  58.33 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 496 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  51 
 
 		 513 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  49.39 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 527 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  50.71 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  49.6 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  44.13 
 
 		 490 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.96 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 489 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  42.14 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 491 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  40.8 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 497 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.58 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.45 
 
 		 485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 494 aa  230  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 494 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 509 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.5 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.12 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.28 
 
 		 494 aa  224  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 504 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 495 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  34.37 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  32.32 
 
 		 504 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 488 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 574 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 477 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.2 
 
 		 490 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.21 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 493 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 478 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  34.66 
 
 		 570 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  34 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 507 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  35.2 
 
 		 493 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 484 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  28.19 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.01 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.96 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 509 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 504 aa  203  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.41 
 
 		 474 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.98 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 473 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 488 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 476 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 569 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.4 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 513 aa  200  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 473 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.72 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.64 
 
 		 508 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.57 
 
 		 517 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 502 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 498 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 510 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1730  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0812  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.646381  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 496 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0611  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.361216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1329  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0544  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 559 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 509 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.41 
 
 		 499 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 509 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.47 
 
 		 497 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 488 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.32 
 
 		 514 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>