More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2327 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 474 aa  984    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.98 
 
 		 486 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.68 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.73 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  36.77 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.45 
 
 		 491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.1 
 
 		 488 aa  310  4e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 466 aa  309  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 463 aa  307  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 466 aa  306  7e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 466 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 466 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  35.85 
 
 		 466 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 473 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.67 
 
 		 472 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.59 
 
 		 472 aa  286  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.76 
 
 		 478 aa  281  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 490 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 510 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.45 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 506 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 477 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 507 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  34.73 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 515 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  34.18 
 
 		 507 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  33.27 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  33.27 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 507 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 569 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.71 
 
 		 471 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 503 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.28 
 
 		 475 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.89 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 521 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.95 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.4 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  33.69 
 
 		 503 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 515 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  33.54 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 495 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.19 
 
 		 485 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 496 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 490 aa  247  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 502 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 492 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.33 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  33.4 
 
 		 523 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  33.26 
 
 		 493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.85 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.97 
 
 		 497 aa  243  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 502 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.97 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 476 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>