More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2022 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 593 aa  1189    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  44.24 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.29 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.08 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  33.28 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  29.64 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.28 
 
 		 486 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 466 aa  287  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 480 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 466 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 471 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 471 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 466 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 466 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 466 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  32.4 
 
 		 479 aa  279  9e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 466 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  29.7 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 466 aa  273  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.26 
 
 		 474 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 473 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.25 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 476 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 454 aa  250  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  27.7 
 
 		 470 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 466 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.27 
 
 		 471 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.29 
 
 		 488 aa  243  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 466 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.8 
 
 		 515 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.64 
 
 		 472 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 477 aa  236  8e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 507 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 473 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 521 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 504 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 513 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 517 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 509 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 490 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 511 aa  231  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.81 
 
 		 497 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  33.46 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 485 aa  230  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.15 
 
 		 497 aa  228  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  31.27 
 
 		 488 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 507 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 509 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 506 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 506 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 506 aa  226  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 506 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 506 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 499 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 492 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 506 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  31.05 
 
 		 520 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  29.96 
 
 		 508 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.45 
 
 		 495 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.39 
 
 		 501 aa  224  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.22 
 
 		 485 aa  223  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 502 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 502 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  24.61 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 502 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.39 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.85 
 
 		 485 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 501 aa  222  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.14 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 475 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 501 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 501 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 493 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 492 aa  220  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.92 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.66 
 
 		 488 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>