More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1143 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 480 aa  954    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  43.04 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  41.29 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 510 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.41 
 
 		 497 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.99 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.05 
 
 		 472 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 492 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 501 aa  283  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 475 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 496 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 501 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.6 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.51 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 477 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.36 
 
 		 507 aa  276  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.42 
 
 		 507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.08 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 506 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 506 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.95 
 
 		 508 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 506 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 511 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.83 
 
 		 523 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 502 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 488 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 506 aa  266  7e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  35.31 
 
 		 507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 490 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.61 
 
 		 500 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  35.73 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 		 488 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 502 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.53 
 
 		 489 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 502 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 488 aa  259  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 499 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 501 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 495 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.17 
 
 		 465 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  34.93 
 
 		 520 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.85 
 
 		 475 aa  256  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.73 
 
 		 501 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  39 
 
 		 502 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 494 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 494 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.01 
 
 		 507 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 501 aa  256  8e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.25 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.82 
 
 		 504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 562 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 569 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  37.87 
 
 		 491 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 494 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 502 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 494 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.22 
 
 		 495 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  39.01 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>