More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4136 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  87.32 
 
 
490 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  100 
 
 
515 aa  1017    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  87.96 
 
 
490 aa  788    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  86.6 
 
 
524 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  85.63 
 
 
515 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  87.91 
 
 
492 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
492 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  58.8 
 
 
491 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 
507 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.46 
 
 
507 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  53.68 
 
 
487 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  49.35 
 
 
486 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.47 
 
 
489 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  47.11 
 
 
492 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  46.47 
 
 
492 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  43.75 
 
 
495 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
488 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  46.85 
 
 
488 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  43.26 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  46.98 
 
 
502 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
511 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
502 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
502 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
502 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
498 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  46.42 
 
 
502 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  46.2 
 
 
502 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.2 
 
 
501 aa  322  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.7 
 
 
494 aa  322  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  41.61 
 
 
502 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
495 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 
501 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
502 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
502 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
501 aa  319  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.15 
 
 
515 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
503 aa  316  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
569 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.53 
 
 
497 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.34 
 
 
497 aa  313  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.41 
 
 
501 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
506 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
506 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
509 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
502 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.37 
 
 
504 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
501 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  39.79 
 
 
502 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  39.57 
 
 
488 aa  310  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  39.49 
 
 
503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  38.82 
 
 
523 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  37.65 
 
 
511 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
506 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.53 
 
 
507 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
507 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
507 aa  309  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  39.96 
 
 
509 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.34 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.28 
 
 
495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  37.32 
 
 
507 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
507 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  39.14 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
492 aa  306  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.89 
 
 
521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  36.95 
 
 
520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.48 
 
 
501 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
506 aa  299  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
546 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
564 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
564 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.21 
 
 
503 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  37.87 
 
 
561 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.21 
 
 
494 aa  297  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
562 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  39.71 
 
 
502 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
493 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
496 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
475 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 
490 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  37.87 
 
 
564 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.46 
 
 
485 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
564 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  37.26 
 
 
490 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  39.61 
 
 
485 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  39.63 
 
 
509 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
494 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
494 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 
494 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  39.34 
 
 
494 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 
471 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>