More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4518 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  99.59 
 
 		 492 aa  957    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  91.45 
 
 		 490 aa  828    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  94.88 
 
 		 490 aa  850    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 524 aa  962    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  91.45 
 
 		 515 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  87.5 
 
 		 515 aa  813    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 492 aa  962    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.59 
 
 		 491 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 507 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.9 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  54.95 
 
 		 487 aa  478  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  47.64 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 492 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.53 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  47.1 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  44.77 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 488 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  47.86 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 511 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 498 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 502 aa  362  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  47.95 
 
 		 502 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 503 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.63 
 
 		 494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 501 aa  322  9.000000000000001e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  39.07 
 
 		 511 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 503 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 501 aa  319  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 502 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  40.68 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 509 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.47 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 506 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 569 aa  316  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 495 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.98 
 
 		 520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  38.09 
 
 		 507 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.09 
 
 		 501 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 507 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  38.09 
 
 		 507 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.79 
 
 		 494 aa  313  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.15 
 
 		 523 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 513 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.84 
 
 		 497 aa  311  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.96 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 507 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.93 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 507 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  39.79 
 
 		 499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.11 
 
 		 497 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 501 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 562 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.61 
 
 		 501 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.59 
 
 		 495 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 		 492 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 521 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 496 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 		 503 aa  300  5e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  40.25 
 
 		 502 aa  300  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  39.06 
 
 		 564 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 475 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 493 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 494 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 494 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 490 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 485 aa  279  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 480 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 478 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 494 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 494 aa  277  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>