More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1330 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5786  transcriptional regulator  94.88 
 
 
492 aa  843    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.61313  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1330  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
490 aa  960    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  91.62 
 
 
490 aa  825    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3850  GntR family transcriptional regulator  94.88 
 
 
524 aa  844    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3950  GntR family transcriptional regulator  91.62 
 
 
515 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115894  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  87.96 
 
 
515 aa  819    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4518  GntR family transcriptional regulator  94.88 
 
 
492 aa  845    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210291  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.31 
 
 
491 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  53.96 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  54.32 
 
 
487 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  47.42 
 
 
492 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.11 
 
 
489 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
492 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  44.23 
 
 
495 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  46.74 
 
 
488 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  48.16 
 
 
502 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
511 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
502 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
498 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
502 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  47.95 
 
 
502 aa  363  3e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
502 aa  361  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  48.38 
 
 
502 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
488 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  42.35 
 
 
488 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
488 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
488 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  42.2 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.14 
 
 
503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.67 
 
 
494 aa  326  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38 
 
 
515 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  38.26 
 
 
511 aa  319  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
503 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.67 
 
 
501 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  41.37 
 
 
502 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
501 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  41.16 
 
 
502 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
509 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
506 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
506 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
506 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
506 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  39.96 
 
 
523 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  40.25 
 
 
509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
513 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
569 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
507 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  37.5 
 
 
501 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
507 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  37.88 
 
 
507 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
507 aa  312  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
506 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 
495 aa  310  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.16 
 
 
504 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
501 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  38.16 
 
 
507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.93 
 
 
507 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.52 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
507 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
475 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 
501 aa  306  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  37.52 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  39.91 
 
 
499 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
546 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.9 
 
 
497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  38.87 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.68 
 
 
521 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  40.27 
 
 
488 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
562 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.16 
 
 
497 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
492 aa  298  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
475 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
496 aa  299  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.55 
 
 
501 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.03 
 
 
495 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  39.29 
 
 
502 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.05 
 
 
503 aa  296  5e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
490 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
564 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  38.87 
 
 
564 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
493 aa  293  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 
485 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  37.61 
 
 
490 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
494 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  37.73 
 
 
520 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.72 
 
 
509 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  39.14 
 
 
480 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
485 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
494 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
494 aa  279  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 
520 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>