More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1064 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1064  transcriptional regulator  100 
 
 		 477 aa  965    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 480 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 496 aa  286  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 464 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 464 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 477 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.79 
 
 		 485 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.26 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.39 
 
 		 509 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.21 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.34 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.77 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  38.43 
 
 		 509 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.75 
 
 		 507 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.16 
 
 		 485 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 507 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 		 495 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 506 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.09 
 
 		 504 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 490 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.37 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.37 
 
 		 507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 504 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  35.92 
 
 		 508 aa  253  7e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.31 
 
 		 497 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 486 aa  250  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.97 
 
 		 481 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 475 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.46 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  36.6 
 
 		 488 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.13 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.58 
 
 		 514 aa  246  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7670  putative transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.16 
 
 		 491 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 490 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 502 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 501 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  33.76 
 
 		 485 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 511 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 513 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 491 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.9 
 
 		 490 aa  242  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 503 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  34.85 
 
 		 520 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  30.82 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 502 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  37.47 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  35.77 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 498 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.98 
 
 		 472 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 521 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 492 aa  239  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.55 
 
 		 473 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  36.32 
 
 		 502 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 489 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 494 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 498 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>