More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3005 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 486 aa  994    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  59.88 
 
 		 479 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  53.53 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.98 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  42.12 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.01 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 466 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.45 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  36.38 
 
 		 466 aa  345  8e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 464 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 466 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 466 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 473 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 466 aa  336  7e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 466 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.39 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  35.76 
 
 		 463 aa  329  8e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 466 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 471 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.96 
 
 		 488 aa  316  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 463 aa  316  8e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  34.51 
 
 		 473 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.03 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 490 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 503 aa  286  8e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 496 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.51 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.2 
 
 		 502 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 502 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.02 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.87 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 509 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  37.32 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.38 
 
 		 501 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 562 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 523 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 569 aa  263  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 517 aa  263  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 509 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.25 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 501 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  37.76 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 520 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.39 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08090  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.71 
 
 		 475 aa  256  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000657612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.49 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.27 
 
 		 515 aa  256  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 470 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  34.8 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.52 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.18 
 
 		 471 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.03 
 
 		 497 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 492 aa  253  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.58 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 493 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  32.93 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 506 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 511 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 509 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 506 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 506 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  34.42 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 478 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.71 
 
 		 471 aa  249  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  33.4 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.74 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>