More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2170 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  76.13 
 
 
471 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
466 aa  962    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  94.85 
 
 
466 aa  899    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1900  GntR family transcriptional regulator  94.64 
 
 
466 aa  887    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000823779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1890  GntR family transcriptional regulator  96.35 
 
 
466 aa  906    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0766739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1937  GntR family transcriptional regulator  90.13 
 
 
466 aa  861    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  94.85 
 
 
466 aa  899    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2116  transcriptional regulator, GntR family  94.42 
 
 
466 aa  892    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  95.49 
 
 
466 aa  899    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  76.99 
 
 
471 aa  734    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  72.96 
 
 
473 aa  698    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
466 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
466 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 
466 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  46.2 
 
 
466 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  47.22 
 
 
466 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  47.13 
 
 
466 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  47.12 
 
 
466 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  46.84 
 
 
466 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  46.91 
 
 
473 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  46.37 
 
 
466 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.27 
 
 
465 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2769  transcriptional regulator  43.35 
 
 
463 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.61 
 
 
464 aa  356  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 
463 aa  345  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  40 
 
 
463 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.14 
 
 
472 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000690216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
484 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.86 
 
 
486 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
464 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2363  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
459 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1297  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 
479 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.71 
 
 
474 aa  309  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0157  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
454 aa  302  9e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.790011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0989  transcriptional regulator  36.38 
 
 
473 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0129526  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0554  regulatory protein GntR HTH  37.63 
 
 
460 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0540  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
460 aa  293  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07570  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.52 
 
 
491 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.716498  normal  0.392489 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18480  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.17 
 
 
488 aa  277  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.423474  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.53 
 
 
514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02430  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  33.76 
 
 
478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
517 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
503 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
502 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  34.94 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.1 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.73 
 
 
503 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
496 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
470 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2022  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.23 
 
 
593 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
490 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
506 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
509 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
490 aa  267  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
506 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
506 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
506 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  34.59 
 
 
509 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
506 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
506 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
569 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.22 
 
 
510 aa  262  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  32.43 
 
 
494 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
494 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  32.25 
 
 
508 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
513 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.85 
 
 
515 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  32.66 
 
 
520 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  32.85 
 
 
511 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
507 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.83 
 
 
507 aa  259  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
494 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
494 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 
520 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  31.85 
 
 
509 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2167  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
465 aa  257  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.4 
 
 
504 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
507 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  32.38 
 
 
507 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
507 aa  255  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  33.47 
 
 
521 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
475 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.99 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.04 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
480 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
492 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4413  transcriptional regulator  32.35 
 
 
490 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336861  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
485 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.54 
 
 
471 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  31.19 
 
 
509 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  32.67 
 
 
476 aa  250  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.24 
 
 
491 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
501 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>