More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6316 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 493 aa  998    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.41 
 
 		 472 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 477 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  45.05 
 
 		 471 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.25 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.16 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40.59 
 
 		 510 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 496 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 509 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 494 aa  299  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.15 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 508 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 494 aa  295  9e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 494 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 494 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 509 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 495 aa  292  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 509 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39 
 
 		 488 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 485 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 489 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 473 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 506 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 506 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.54 
 
 		 488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  33.26 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.4 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.38 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 504 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 476 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 516 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.31 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 490 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 478 aa  281  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 513 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 516 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 485 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.42 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 492 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.35 
 
 		 485 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 506 aa  279  7e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 501 aa  279  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 504 aa  279  9e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 503 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  34.75 
 
 		 521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 507 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 507 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 569 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 470 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 475 aa  273  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 501 aa  272  9e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 488 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 497 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 502 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 520 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 		 495 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.15 
 
 		 499 aa  269  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 498 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 481 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.15 
 
 		 495 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 493 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  35.73 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 		 497 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 502 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 475 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 		 474 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.8 
 
 		 497 aa  266  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.31 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 503 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.39 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.69 
 
 		 465 aa  264  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>