More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0565 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
493 aa  1017    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  45.92 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  40.61 
 
 
508 aa  388  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3329  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.895754  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
490 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  35.91 
 
 
537 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.43 
 
 
485 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.4 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 
470 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.96 
 
 
485 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
494 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.27 
 
 
471 aa  264  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
504 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  33.98 
 
 
509 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
477 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  34.38 
 
 
494 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 
479 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
504 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
494 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
494 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
496 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.15 
 
 
465 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.64 
 
 
464 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
507 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.83 
 
 
472 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
475 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  32.85 
 
 
510 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  34.76 
 
 
495 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.2 
 
 
486 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
493 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
492 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
507 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  33.47 
 
 
507 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
485 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.36 
 
 
485 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3060  putative transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 
464 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
485 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  32.08 
 
 
485 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
496 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.41 
 
 
503 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
574 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  33 
 
 
507 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
507 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
507 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.08 
 
 
515 aa  246  9e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  34.21 
 
 
493 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  34.01 
 
 
570 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
490 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  33.13 
 
 
511 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  34.01 
 
 
493 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  33.69 
 
 
509 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  33.66 
 
 
498 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
509 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.06 
 
 
490 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  33.69 
 
 
509 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
492 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.75 
 
 
481 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
509 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 
463 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
484 aa  240  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
473 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
513 aa  240  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
490 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  33.68 
 
 
489 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
506 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
492 aa  237  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4874  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.56 
 
 
470 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.13 
 
 
509 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.24 
 
 
488 aa  236  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 
471 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2184  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 
466 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2075  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
487 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4220  transcriptional regulator  33.64 
 
 
498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0549484  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  34.37 
 
 
481 aa  234  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
493 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.39 
 
 
501 aa  233  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 
501 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2170  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
466 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.662886  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  32.25 
 
 
521 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  32.37 
 
 
503 aa  233  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
466 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
466 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 
466 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
517 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
466 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
491 aa  232  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
473 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>