More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1916 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2034  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 
500 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1059  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 
500 aa  833    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611003  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1775  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 
500 aa  833    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0682  GntR family transcriptional regulator  85.6 
 
 
500 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.984752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2058  GntR family regulatory protein  85.6 
 
 
500 aa  830    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
500 aa  992    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0766  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 
500 aa  833    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.106463  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0773  GntR family transcriptional regulator  86 
 
 
500 aa  832    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199423  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
493 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  64.23 
 
 
493 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  63.62 
 
 
493 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  62.8 
 
 
495 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  62.58 
 
 
494 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
569 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
470 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
496 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.5 
 
 
501 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.81 
 
 
502 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.25 
 
 
503 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 
477 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
502 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
502 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.96 
 
 
502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
490 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
494 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
502 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  36.88 
 
 
494 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
494 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
490 aa  259  9e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.43 
 
 
515 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 
523 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
503 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  36.85 
 
 
509 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
501 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
494 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
494 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.74 
 
 
495 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.64 
 
 
481 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
507 aa  256  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.19 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
564 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
509 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
506 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
505 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
506 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.86 
 
 
513 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
475 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2327  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.05 
 
 
474 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  34.09 
 
 
504 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
506 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  36.48 
 
 
509 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.19 
 
 
504 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.41 
 
 
473 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.02 
 
 
485 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.24 
 
 
495 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.53 
 
 
496 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.95 
 
 
507 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
507 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  35.26 
 
 
520 aa  249  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
492 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  35.08 
 
 
520 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  37.09 
 
 
476 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  36.74 
 
 
511 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
562 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.38 
 
 
509 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.67 
 
 
485 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.26 
 
 
507 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.93 
 
 
514 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
507 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
507 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  36.32 
 
 
498 aa  247  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  35.03 
 
 
509 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
506 aa  247  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.81 
 
 
523 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.68 
 
 
472 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  36.27 
 
 
506 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  34.47 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  33.62 
 
 
476 aa  245  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
564 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
496 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  36.19 
 
 
564 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
463 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.26 
 
 
499 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  35.02 
 
 
516 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.84 
 
 
503 aa  243  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.53 
 
 
489 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  32.83 
 
 
475 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.97 
 
 
471 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
509 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.12 
 
 
499 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 
501 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0661  transcriptional regulator  37.47 
 
 
513 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.13 
 
 
521 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>