More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0611 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0544  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
559 aa  1127    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0812  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
486 aa  978    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.646381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1533  GntR family transcriptional regulator  99.11 
 
 
559 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1730  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
486 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1557  GntR family transcriptional regulator  99.47 
 
 
379 aa  767    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0611  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
559 aa  1127    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.361216  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1329  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
559 aa  1127    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.401232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4617  GntR family transcriptional regulator  54.34 
 
 
480 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
501 aa  287  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
569 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
492 aa  281  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
493 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.49 
 
 
503 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
490 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  37.37 
 
 
511 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
507 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.19 
 
 
495 aa  268  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
495 aa  266  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
492 aa  266  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.31 
 
 
501 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.74 
 
 
503 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  37.45 
 
 
502 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
502 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.02 
 
 
497 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.93 
 
 
515 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
503 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  36.46 
 
 
507 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
507 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
507 aa  260  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.81 
 
 
497 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  38.51 
 
 
502 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  36.25 
 
 
507 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
507 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.82 
 
 
502 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  35.15 
 
 
499 aa  258  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
502 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 
502 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  36.46 
 
 
521 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  39.18 
 
 
510 aa  256  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  36.09 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
509 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
513 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 
492 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
473 aa  253  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
506 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
506 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 
496 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
506 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.84 
 
 
523 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
506 aa  252  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  38.4 
 
 
506 aa  250  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
564 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
546 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  36.18 
 
 
561 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 
564 aa  250  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  37.99 
 
 
492 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 
501 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
501 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
486 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
496 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.03 
 
 
496 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
494 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  36.61 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
488 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
488 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.15 
 
 
485 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  35.41 
 
 
475 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.6 
 
 
523 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.98 
 
 
501 aa  243  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
477 aa  243  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
501 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.88 
 
 
495 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
494 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
562 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  35.11 
 
 
520 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  34.5 
 
 
476 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
494 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
494 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
501 aa  240  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 
564 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  36 
 
 
564 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2189  GntR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
499 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199182  hitchhiker  0.00899301 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.62 
 
 
489 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.38 
 
 
509 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  34.96 
 
 
485 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
504 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.59 
 
 
494 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  35.99 
 
 
507 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.76 
 
 
507 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.67 
 
 
485 aa  236  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  37.5 
 
 
487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
492 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  34.34 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  36.21 
 
 
495 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  33.61 
 
 
504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>