More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0046 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  100 
 
 		 490 aa  1016    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 486 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.45 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 508 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  41.53 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 508 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  42.56 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  40.81 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.33 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 527 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 512 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 508 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 495 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  36.27 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 499 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  31.17 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.26 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 506 aa  201  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 491 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.74 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  30.61 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.91 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0090  aminotransferase, MocR-like  28.19 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.97 
 
 		 497 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  33.01 
 
 		 508 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 506 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0638  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 574 aa  195  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.74 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0551  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0582  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.915495  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 479 aa  193  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.67 
 
 		 488 aa  193  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2951  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 475 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.604196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.45 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0493  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 466 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.393759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0495  GntR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 466 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  28.42 
 
 		 475 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  28.39 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  28.26 
 
 		 509 aa  190  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0646  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.74 
 
 		 488 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0620  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3030  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3230  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.34 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0077  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.994833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  28.13 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  28.13 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 502 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 501 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 501 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.75 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 493 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 484 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 569 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1567  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1938  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 507 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2085  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0496  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 494 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>