More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3667 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3272  transcriptional regulator  83.2 
 
 
493 aa  826    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1766  GntR family transcriptional regulator  84.1 
 
 
495 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0178968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4121  GntR family transcriptional regulator  82.59 
 
 
493 aa  818    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.648363  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3667  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
494 aa  995    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4245  GntR family transcriptional regulator  82.59 
 
 
493 aa  818    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0459012 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1916  GntR family transcriptional regulator  62.58 
 
 
500 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1775  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1059  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.611003  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0766  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.106463  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2034  GntR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
500 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0682  GntR family transcriptional regulator  61.99 
 
 
500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.984752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2058  GntR family regulatory protein  61.99 
 
 
500 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.51988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0773  GntR family transcriptional regulator  61.79 
 
 
500 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.199423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
496 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
470 aa  273  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  35.36 
 
 
523 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
569 aa  272  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
494 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
494 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
494 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  38.29 
 
 
494 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
504 aa  267  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  36.4 
 
 
502 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  36.3 
 
 
503 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
502 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.92 
 
 
515 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  37.8 
 
 
509 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  36.53 
 
 
502 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
507 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
502 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
502 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
503 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
494 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  34.61 
 
 
509 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
509 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 
501 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
564 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
546 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  35.43 
 
 
561 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
564 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  34.49 
 
 
520 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  35.9 
 
 
507 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
507 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  35.09 
 
 
508 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  37.58 
 
 
495 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
562 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
501 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.97 
 
 
507 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
490 aa  258  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.09 
 
 
473 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
509 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
520 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  35.37 
 
 
495 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
495 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  35.91 
 
 
511 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
513 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  35.37 
 
 
521 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  35.43 
 
 
564 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
564 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.73 
 
 
501 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
492 aa  256  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  35.67 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  34.15 
 
 
520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6170  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.15 
 
 
523 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  38.24 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  33.76 
 
 
501 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.83 
 
 
471 aa  253  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
501 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.05 
 
 
472 aa  252  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
506 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  37.93 
 
 
476 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
490 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
506 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
509 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
506 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
506 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
506 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
506 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 
503 aa  248  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 
444 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.22 
 
 
514 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
477 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.46 
 
 
495 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.96 
 
 
476 aa  246  8e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
492 aa  246  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  37.58 
 
 
502 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.13 
 
 
485 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 
492 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.81 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.81 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  34.61 
 
 
458 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.12333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>