More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2525 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  94.81 
 
 
482 aa  947    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  95.02 
 
 
482 aa  951    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  94.97 
 
 
477 aa  937    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  95.02 
 
 
482 aa  951    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  95.02 
 
 
482 aa  951    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  100 
 
 
482 aa  989    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  95.02 
 
 
482 aa  951    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  95.02 
 
 
482 aa  950    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  95.64 
 
 
482 aa  951    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  96.06 
 
 
482 aa  958    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  45.17 
 
 
519 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
520 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.9 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
477 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
498 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.48 
 
 
500 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  27.39 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
547 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.32 
 
 
498 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.9 
 
 
468 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  31.59 
 
 
395 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
401 aa  207  3e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 
397 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
395 aa  206  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
520 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.42 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 
396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.42 
 
 
503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.99 
 
 
401 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
395 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
403 aa  196  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
477 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
395 aa  196  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  29.51 
 
 
397 aa  196  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 
477 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 
398 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
414 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 
377 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  27.89 
 
 
485 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
480 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
478 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
490 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
395 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  31.77 
 
 
397 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 
477 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 
480 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 
400 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
480 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  30.48 
 
 
400 aa  193  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 
477 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.51 
 
 
480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  28.97 
 
 
417 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
396 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
480 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
480 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
480 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  26.97 
 
 
493 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.51 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
480 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  25.37 
 
 
480 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
398 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.81 
 
 
464 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.1 
 
 
483 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  31.42 
 
 
402 aa  188  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.25 
 
 
480 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  27.24 
 
 
523 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 
480 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 
398 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
480 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
400 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 
461 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  31.21 
 
 
400 aa  186  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  29.16 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0205  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 
463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
405 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  27 
 
 
404 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  27.27 
 
 
433 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
468 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
340 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0708  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 
466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
463 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 
401 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
477 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.31 
 
 
494 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  26.4 
 
 
503 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
386 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  29.86 
 
 
406 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.08 
 
 
477 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.63 
 
 
515 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
480 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>