More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1580 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  93.67 
 
 		 395 aa  759    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  91.39 
 
 		 395 aa  741    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  79.13 
 
 		 395 aa  661    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 395 aa  803    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  45.82 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  44.13 
 
 		 397 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  43.48 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  43.73 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 383 aa  362  8e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 393 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  43.7 
 
 		 393 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  43.7 
 
 		 393 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  43.19 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  44.53 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  47.73 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 398 aa  356  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.93 
 
 		 393 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  43.48 
 
 		 393 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  43.26 
 
 		 398 aa  353  4e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  43.52 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 393 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  44.58 
 
 		 406 aa  350  4e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  41.54 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  41.79 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 396 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  42.89 
 
 		 397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  42.75 
 
 		 394 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 393 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  40.31 
 
 		 404 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.51 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  40.93 
 
 		 400 aa  329  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 405 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 611 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  40.85 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  40.4 
 
 		 410 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.11 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  40.4 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 411 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 406 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 403 aa  309  5e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 410 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 411 aa  308  9e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 408 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 413 aa  306  6e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.15 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 463 aa  305  9.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  37.22 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.03 
 
 		 399 aa  303  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  39.41 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36.99 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  36.73 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 		 406 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  39.68 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  35.7 
 
 		 441 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.08 
 
 		 446 aa  298  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.31 
 
 		 420 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 395 aa  295  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 454 aa  294  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 411 aa  293  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 401 aa  292  9e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  36.53 
 
 		 440 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.52 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 377 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>