More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3297 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  988    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  58.79 
 
 		 484 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.61 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 477 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 498 aa  269  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  35.86 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  32.56 
 
 		 485 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 478 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.84 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 520 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.64 
 
 		 490 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 477 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.12 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  31.22 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  30.91 
 
 		 477 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.36 
 
 		 468 aa  232  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.91 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  38.19 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.82 
 
 		 477 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 454 aa  230  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 477 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 477 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 477 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 477 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.29 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.96 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 479 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  33.96 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.5 
 
 		 477 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 461 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  30.33 
 
 		 477 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 437 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 503 aa  223  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.45 
 
 		 483 aa  221  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 480 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 470 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 398 aa  220  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  33.52 
 
 		 404 aa  219  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.03 
 
 		 433 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  29.98 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.15 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  30.75 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 480 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 468 aa  216  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.11 
 
 		 437 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 437 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.56 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.69 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1887  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  35.75 
 
 		 406 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 397 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.36 
 
 		 416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.7 
 
 		 483 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.27 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 430 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1618  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 468 aa  213  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01396  fused predicted DNA-binding transcriptional regulator/predicted amino transferase  32.05 
 
 		 468 aa  213  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.05 
 
 		 468 aa  213  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  30.69 
 
 		 478 aa  213  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2220  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 468 aa  213  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.94237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01407  hypothetical protein  32.05 
 
 		 468 aa  213  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  31.03 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 473 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>