More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2746 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  77.89 
 
 		 400 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  77.53 
 
 		 398 aa  634    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 397 aa  805    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  83.54 
 
 		 395 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  79.55 
 
 		 398 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  82.78 
 
 		 395 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  77.89 
 
 		 414 aa  635    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  74.43 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  73.35 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  58.12 
 
 		 402 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  58.12 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  57.61 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  45.88 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  44.02 
 
 		 396 aa  345  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  44.27 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  45.22 
 
 		 398 aa  338  9e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  44.7 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 393 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  42.75 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 		 394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 395 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  45.57 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  44.81 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  44.81 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  40.86 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.87 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  41.37 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  39.54 
 
 		 400 aa  299  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.09 
 
 		 377 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.36 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 393 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 398 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  40.05 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 		 394 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 393 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  42.28 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.75 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.44 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  41.19 
 
 		 426 aa  289  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.69 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  42.6 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  42.36 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  42.36 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  36.02 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  41.54 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 400 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  42.11 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  38.9 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  36.22 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.69 
 
 		 393 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  40.53 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.19 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 398 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.66 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 395 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  40.3 
 
 		 406 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.4 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  41.94 
 
 		 410 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 450 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  35.25 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 393 aa  265  8e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  40.36 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 407 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>