More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2807 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 400 aa  784    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  75.38 
 
 		 395 aa  585  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  62.04 
 
 		 377 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  62.18 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  60.05 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  48.29 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  50.13 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  49.21 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  49.61 
 
 		 393 aa  332  6e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  49.09 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  48.82 
 
 		 398 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  48.04 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 397 aa  322  7e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  47.66 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  44.85 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  41.09 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  47.24 
 
 		 417 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  37.92 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  45.97 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  47.66 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  47.66 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  47.66 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  47.66 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  47.66 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  44.16 
 
 		 404 aa  311  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  47.66 
 
 		 393 aa  311  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  45.67 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  42.75 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  43.26 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  44.33 
 
 		 394 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  44.16 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 395 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  40.32 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  44.5 
 
 		 402 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  46.21 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 396 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 		 402 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  43.22 
 
 		 402 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  41.48 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  42.82 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  43.86 
 
 		 398 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 399 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  43.8 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 395 aa  292  9e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  41.51 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  48.28 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  48.28 
 
 		 408 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.54 
 
 		 400 aa  290  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  48.28 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 441 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  43.78 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  41.65 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 388 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  40.62 
 
 		 440 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  45.78 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  47.33 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  38.9 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  41.07 
 
 		 441 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  44.62 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  40.36 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 450 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  40.93 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  45.6 
 
 		 407 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.21 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 397 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>