More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3440 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_5148  GntR family transcriptional regulator  91.71 
 
 		 399 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2654  aminotransferase, class I and II  94.74 
 
 		 424 aa  739    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.422177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3440  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 399 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5262  aminotransferase, class I and II  98.75 
 
 		 399 aa  797    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.276106  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4020  GntR family transcriptional regulator  95.24 
 
 		 399 aa  750    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.199262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3498  aminotransferase, class I and II  95.49 
 
 		 399 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  69.62 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  67.34 
 
 		 398 aa  544  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  52.97 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5662  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 425 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182521  hitchhiker  0.00876567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  49.12 
 
 		 400 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  47.34 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1984  aminotransferase, class I/II  53.44 
 
 		 408 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0496  aminotransferase family protein  53.44 
 
 		 408 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2081  aminotransferase, class I/II  53.44 
 
 		 408 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0896  aminotransferase family protein  52.82 
 
 		 406 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  46.04 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  45.78 
 
 		 402 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  45.06 
 
 		 397 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  43.94 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  46.72 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0679  aminotransferase family protein  50 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0778  aminotransferase family protein  50 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1632  aminotransferase family protein  50 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0567  aminotransferase family protein  50 
 
 		 371 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  44.3 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  42.52 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  41.99 
 
 		 394 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 400 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  40.93 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 393 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  42.74 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  45.43 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.41 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  41.16 
 
 		 398 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.17 
 
 		 463 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  41.16 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  41.16 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.9 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.9 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 413 aa  272  8.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3951  aminotransferase, class I and II  40.92 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0704499  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  41.42 
 
 		 393 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  41.16 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.35 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.99 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  41.42 
 
 		 393 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.13 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.86 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 416 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 414 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 409 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.5 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.32 
 
 		 397 aa  252  9.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.92 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.81 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 399 aa  249  9e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3585  putative transcriptional regulator, GntR family  42.64 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.06961  normal  0.158236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.5 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  37.53 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 411 aa  243  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.95 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>