More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3845 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  99.3 
 
 		 426 aa  858    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  82.28 
 
 		 398 aa  643    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 426 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  76.03 
 
 		 406 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  69.76 
 
 		 450 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  78.46 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  75.52 
 
 		 406 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  74.54 
 
 		 416 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  68.06 
 
 		 420 aa  542  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  63.59 
 
 		 407 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  64.29 
 
 		 402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  54.62 
 
 		 404 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  56.01 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  56.23 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  54.12 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  54.12 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  54.9 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  54.03 
 
 		 406 aa  411  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  53.79 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  54.64 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  53.79 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  54.12 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  54.12 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  53.55 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  53.55 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  48.35 
 
 		 397 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 383 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  42.2 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  44.58 
 
 		 394 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  47.85 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  45.18 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  45.18 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  46.91 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  43.77 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 395 aa  309  8e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  40.82 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  45.45 
 
 		 402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  40.51 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  44.22 
 
 		 404 aa  299  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  40.41 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  40.66 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 393 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  40.91 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 441 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 446 aa  292  9e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  39.28 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  39.56 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  41.21 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 398 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  37.81 
 
 		 611 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  40.51 
 
 		 397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  39.18 
 
 		 439 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.4 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  39.49 
 
 		 437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  42.47 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  42.47 
 
 		 410 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 408 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 		 438 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  40.4 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.53 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 398 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 399 aa  279  7e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 410 aa  279  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 413 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.66 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.04 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 409 aa  276  6e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  38.78 
 
 		 463 aa  275  8e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  41.48 
 
 		 406 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  39.64 
 
 		 416 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>