More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1681 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 401 aa  830    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  63.1 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  53.06 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  53.32 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0861  GntR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.543615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  50.63 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0464  GntR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000813443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  48.08 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  47.57 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  47.83 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  47.31 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  47.57 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1460  aminotransferase, class I and II  48.84 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  45.22 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  46.41 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  44.7 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  45.64 
 
 		 417 aa  352  8.999999999999999e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  46.41 
 
 		 394 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  46.49 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  45.71 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  43.37 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  43.97 
 
 		 406 aa  326  5e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 383 aa  325  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 405 aa  317  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 398 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  44.41 
 
 		 406 aa  309  6.999999999999999e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 340 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  40.55 
 
 		 404 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  40.84 
 
 		 420 aa  306  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 407 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.73 
 
 		 377 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 		 426 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 397 aa  302  7.000000000000001e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  43.42 
 
 		 416 aa  302  8.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 426 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.24 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 416 aa  296  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.78 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  37.31 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  42.6 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 611 aa  286  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  40.44 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  38.46 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 398 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  37.22 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  37.22 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 413 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 441 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  38.64 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  38.78 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 437 aa  279  7e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 438 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 411 aa  276  5e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.48 
 
 		 440 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>