More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5940 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
463 aa  941    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  50.97 
 
 
433 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  44.76 
 
 
436 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  45.59 
 
 
438 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.96 
 
 
432 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  45.48 
 
 
436 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  46.72 
 
 
416 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  41.96 
 
 
440 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
416 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  43.84 
 
 
441 aa  360  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  42.2 
 
 
446 aa  361  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  43.63 
 
 
430 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  44.1 
 
 
440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  46.67 
 
 
416 aa  355  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  42.42 
 
 
439 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  41.52 
 
 
400 aa  349  6e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  40.14 
 
 
438 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
441 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  42.04 
 
 
611 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  42.89 
 
 
437 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
403 aa  334  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  40.99 
 
 
433 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
409 aa  330  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 
414 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  41.92 
 
 
397 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 
383 aa  322  6e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
413 aa  322  7e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  40.68 
 
 
454 aa  322  7e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  39.51 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
395 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 
399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  43 
 
 
417 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 
403 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.1 
 
 
399 aa  306  7e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
395 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  39.8 
 
 
401 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
386 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
411 aa  300  4e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.4 
 
 
397 aa  297  2e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.85 
 
 
393 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
401 aa  295  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
393 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  40.35 
 
 
393 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  40.35 
 
 
393 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  40.1 
 
 
393 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
393 aa  294  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  41.31 
 
 
406 aa  293  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  39.36 
 
 
393 aa  292  7e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
405 aa  292  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 
396 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 
396 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 
396 aa  289  7e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  39.6 
 
 
393 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
398 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.11 
 
 
411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  35.95 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
388 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.66 
 
 
398 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  41.86 
 
 
377 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  39.64 
 
 
394 aa  282  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 
402 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
410 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 
397 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  39.36 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  39.36 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  39.36 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  39.36 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  39.36 
 
 
393 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  38.68 
 
 
394 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
398 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  39.36 
 
 
393 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.25 
 
 
404 aa  280  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 
398 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
411 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  39.61 
 
 
404 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.61 
 
 
402 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
340 aa  279  9e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
411 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
411 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 
396 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.37 
 
 
404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  36.66 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  36.66 
 
 
410 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0109  putative transcriptional regulator, GntR family  35.97 
 
 
396 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  38.24 
 
 
394 aa  273  6e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 
398 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>