More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4022 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  87.67 
 
 		 435 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 433 aa  885    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  51.95 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  52.66 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  52.63 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  51.87 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  51.78 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  49.01 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  49.36 
 
 		 611 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  50.13 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  48.79 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  49.87 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  50.89 
 
 		 440 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  48.84 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  47.73 
 
 		 436 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  47.67 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  48.35 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  46.79 
 
 		 440 aa  388  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  47.76 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  46.52 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  44.55 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  43.69 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  41.29 
 
 		 433 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  40.99 
 
 		 463 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  42.16 
 
 		 416 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  40.92 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  40.97 
 
 		 398 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  40.41 
 
 		 393 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  40.97 
 
 		 398 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 393 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  39.75 
 
 		 393 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.15 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.61 
 
 		 394 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.9 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  40.66 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  40.66 
 
 		 393 aa  299  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.13 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  40 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 399 aa  293  6e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 395 aa  293  6e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.49 
 
 		 417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  37.19 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 411 aa  285  8e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 413 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 426 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 399 aa  281  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 411 aa  277  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.47 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 411 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 426 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.8 
 
 		 406 aa  265  8e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 395 aa  265  8.999999999999999e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.13 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.1 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 396 aa  263  6.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  38.48 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 398 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 397 aa  260  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  36.52 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 405 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.77 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.67 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 402 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.48 
 
 		 402 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>