More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1614 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  96.59 
 
 
411 aa  810    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
411 aa  833    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  63.99 
 
 
411 aa  575  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  64.96 
 
 
411 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  61.07 
 
 
411 aa  548  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  56.59 
 
 
413 aa  481  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 
400 aa  299  5e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
395 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 
395 aa  296  6e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 
399 aa  293  3e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 
401 aa  291  2e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 
403 aa  286  5e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
399 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  39.95 
 
 
399 aa  285  8e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  38.05 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  40.05 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
386 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  37.18 
 
 
463 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
395 aa  280  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  37.85 
 
 
440 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.77 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
416 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
401 aa  273  5.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 
438 aa  272  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 
437 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  38 
 
 
396 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  38.94 
 
 
433 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
438 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  38.85 
 
 
401 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
435 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.59 
 
 
398 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 
436 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.13 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  38.44 
 
 
393 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.19 
 
 
393 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 
397 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
399 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  37.17 
 
 
404 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.02 
 
 
436 aa  264  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 
440 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 
398 aa  262  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 
398 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
393 aa  260  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  36.67 
 
 
454 aa  260  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 
611 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.94 
 
 
393 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  38.35 
 
 
393 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  38.35 
 
 
393 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
393 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 
446 aa  257  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  35.84 
 
 
397 aa  256  4e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.95 
 
 
416 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
393 aa  256  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
393 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 
393 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.24 
 
 
394 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.19 
 
 
404 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  34.27 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.46 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.19 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 
394 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
397 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
437 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.46 
 
 
406 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 
430 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 
394 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
441 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
432 aa  248  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
410 aa  246  6e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 
441 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.41 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
396 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  35.39 
 
 
410 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
383 aa  244  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  35.39 
 
 
410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
388 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
405 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.59 
 
 
416 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  35.21 
 
 
406 aa  240  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
450 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  35.24 
 
 
390 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
406 aa  237  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  34.79 
 
 
405 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 
426 aa  232  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 
394 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  33.82 
 
 
420 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 
426 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>