More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2905 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 383 aa  345  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 397 aa  328  6e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  47.98 
 
 		 396 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  47.2 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  45.75 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  46.57 
 
 		 393 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  46.73 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  46.57 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  44.51 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  45.67 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  45.07 
 
 		 393 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  45.26 
 
 		 401 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 393 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  45.37 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  45.37 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  45.07 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 393 aa  302  5.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  46.43 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  46.27 
 
 		 393 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  44.78 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  45.82 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  47.06 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 388 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  48.63 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  43.43 
 
 		 397 aa  292  6e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  43.43 
 
 		 400 aa  291  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  42.69 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 405 aa  282  5.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  42.09 
 
 		 396 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  42.09 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 450 aa  279  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  42.41 
 
 		 377 aa  279  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  39.35 
 
 		 463 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  44.06 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  42.11 
 
 		 395 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  43.96 
 
 		 394 aa  275  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.28 
 
 		 432 aa  273  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 399 aa  272  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  45.68 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  43.67 
 
 		 404 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  45.54 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  43.12 
 
 		 436 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.37 
 
 		 517 aa  269  5e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  42.19 
 
 		 437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  40.18 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  40.8 
 
 		 399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 425 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  42.15 
 
 		 414 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.28 
 
 		 446 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  41.25 
 
 		 386 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  39.27 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  39.94 
 
 		 400 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  39.81 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  40.73 
 
 		 436 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 441 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  40.98 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  42.64 
 
 		 410 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  41.69 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  42.64 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  40.24 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  42.44 
 
 		 406 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  40.13 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  39.63 
 
 		 438 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  39.87 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  41.81 
 
 		 401 aa  255  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 397 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  42.99 
 
 		 411 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  41.69 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  40.3 
 
 		 416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 403 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>