More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0924 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 397 aa  801    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 397 aa  714    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  54.18 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  41.53 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.9 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 401 aa  257  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  37.84 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 395 aa  252  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 340 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 441 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  41.14 
 
 		 394 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 403 aa  249  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 441 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 437 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  38.75 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.51 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  40.65 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  37.7 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.67 
 
 		 517 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  36.57 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  36.1 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.23 
 
 		 436 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  36.99 
 
 		 416 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.59 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  34.51 
 
 		 399 aa  236  8e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.33 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.33 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.73 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.44 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 414 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  39.45 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  35.87 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.94 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 		 420 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2807  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  38.11 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 450 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.1 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.86 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 407 aa  229  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 398 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 398 aa  229  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 405 aa  229  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 438 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.67 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.67 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.67 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 520 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  40.63 
 
 		 416 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 		 611 aa  225  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  37.64 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  38.15 
 
 		 500 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  35.64 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  37.16 
 
 		 404 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 393 aa  222  7e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.27 
 
 		 416 aa  223  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 395 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.29 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>