More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0318 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 432 aa  888    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  50.72 
 
 		 416 aa  436  1e-121  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  42.09 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.96 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  43.52 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  42.96 
 
 		 463 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  43.69 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  42.82 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  41.96 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  42.51 
 
 		 416 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  42.58 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  42.22 
 
 		 439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  42.71 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 416 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  42 
 
 		 440 aa  358  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  42.79 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  41.55 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  42.04 
 
 		 436 aa  355  7.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 		 611 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  41.56 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  39.9 
 
 		 454 aa  336  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  39.95 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.65 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 399 aa  320  3e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.41 
 
 		 399 aa  318  2e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 403 aa  315  8e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 397 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 396 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 405 aa  282  8.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 411 aa  274  3e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36.18 
 
 		 402 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 402 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 398 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  34.94 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.34 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  37.62 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  37.62 
 
 		 410 aa  266  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.86 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 398 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  41.21 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 398 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.79 
 
 		 411 aa  259  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  33.25 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 		 393 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  33.99 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  35.33 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  35.6 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 410 aa  256  5e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 406 aa  256  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  35.8 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3004  aminotransferase, class I and II  36.8 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.184923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  36.91 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 398 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  35.73 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2514  aminotransferase, class I and II  35.23 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.483717  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 396 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  32.76 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>