More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1052 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 398 aa  796    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  54.18 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 425 aa  288  9e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.85 
 
 		 463 aa  269  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  42.08 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 340 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  35.73 
 
 		 432 aa  250  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 397 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 416 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.98 
 
 		 517 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 395 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  36.02 
 
 		 433 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  40.76 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  34.86 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.68 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 402 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 394 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.75 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.66 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  33.51 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 400 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.84 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 441 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  36.39 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  34.92 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  39.12 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  39.12 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 393 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  35.04 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.73 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  36.93 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  36.87 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  33.84 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  37.75 
 
 		 416 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 437 aa  226  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 393 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  33.93 
 
 		 439 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.74 
 
 		 393 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.47 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 399 aa  223  4e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 404 aa  223  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  34.26 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.19 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  34.26 
 
 		 440 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 500 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 438 aa  219  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.76 
 
 		 433 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 405 aa  219  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 450 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.53 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1642  aminotransferase class I and II  34.42 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2576  putative aminotransferase  36.18 
 
 		 398 aa  217  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.124725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 409 aa  216  5e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  35.01 
 
 		 554 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 401 aa  216  8e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 411 aa  216  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 440 aa  215  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 611 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  35.7 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  38.46 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  35.31 
 
 		 395 aa  212  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0898  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0721886  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>