More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2027 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  761    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3001  GntR family transcriptional regulator  79.32 
 
 		 383 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0003  putative transcriptional regulator, GntR family  47.49 
 
 		 378 aa  324  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.761486  hitchhiker  0.000119798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 397 aa  258  8e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.16 
 
 		 438 aa  252  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.87 
 
 		 446 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 403 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.17 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.96 
 
 		 436 aa  233  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1052  putative transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  38.61 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 436 aa  229  6e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 611 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.99 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  37.6 
 
 		 437 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 437 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  34.29 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.51 
 
 		 517 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  36.05 
 
 		 440 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  35.77 
 
 		 416 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  32.54 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.77 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  36.97 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.03 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  37.04 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.23 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.13 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.77 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 401 aa  216  8e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.77 
 
 		 396 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 403 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  34.14 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.27 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 463 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 398 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 395 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  34.68 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.6 
 
 		 404 aa  208  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  34.79 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 450 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.25 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  34.49 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.25 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  35.45 
 
 		 435 aa  205  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 500 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  37.85 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 398 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 426 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  37.23 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 404 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  29.97 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 520 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  36.77 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  40.89 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.54 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  32.74 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 498 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 396 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5576  putative 2-aminoadipate transaminase  36.83 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.981257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>