More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3364 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  100 
 
 
498 aa  1010    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  40.7 
 
 
493 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  38.45 
 
 
484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.68 
 
 
517 aa  300  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
498 aa  297  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
547 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 
383 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 
400 aa  270  4e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  40.81 
 
 
417 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 
480 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  35.26 
 
 
500 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
478 aa  259  9e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
520 aa  259  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
477 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.77 
 
 
397 aa  259  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.59 
 
 
468 aa  259  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  30.42 
 
 
485 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  30.98 
 
 
480 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 
554 aa  256  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 
477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
394 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.22 
 
 
377 aa  253  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
481 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
403 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
461 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 
340 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 
396 aa  250  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.07 
 
 
490 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 
396 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 
402 aa  249  8e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  30.08 
 
 
480 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 
402 aa  249  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
406 aa  249  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 
396 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  30.79 
 
 
503 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.87 
 
 
406 aa  246  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  38.73 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 
397 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
395 aa  244  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 
397 aa  244  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 
463 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.53 
 
 
395 aa  243  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.17 
 
 
406 aa  243  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
477 aa  242  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.71 
 
 
477 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
477 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.93 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.93 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  31.83 
 
 
479 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
393 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
450 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
477 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 
477 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
477 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 
425 aa  239  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  38.2 
 
 
397 aa  239  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  37.08 
 
 
433 aa  238  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
397 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
398 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 
398 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  36.19 
 
 
397 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  33.42 
 
 
395 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  35.81 
 
 
404 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.67 
 
 
393 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  36.53 
 
 
394 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.21 
 
 
470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  33.7 
 
 
404 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  30.49 
 
 
483 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.6 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.87 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
401 aa  234  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 
394 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
399 aa  234  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  41.13 
 
 
402 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.67 
 
 
393 aa  233  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
496 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
395 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  35.88 
 
 
420 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
398 aa  232  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
414 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 
386 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 
477 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  33.77 
 
 
399 aa  231  2e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  37.6 
 
 
400 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  35.97 
 
 
437 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
437 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
496 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  31.58 
 
 
470 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
395 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  34.84 
 
 
404 aa  229  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  38.14 
 
 
402 aa  229  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
470 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>