More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2409 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  86.74 
 
 
477 aa  870    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  86.55 
 
 
477 aa  873    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  85.92 
 
 
477 aa  867    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  86.76 
 
 
477 aa  872    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  87.5 
 
 
477 aa  868    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  86.55 
 
 
477 aa  873    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  100 
 
 
479 aa  988    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  87.71 
 
 
477 aa  870    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  86.34 
 
 
477 aa  869    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.33 
 
 
490 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
477 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.67 
 
 
517 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.76 
 
 
498 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
498 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.22 
 
 
493 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
477 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
547 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
477 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
477 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.79 
 
 
477 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.04 
 
 
477 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.79 
 
 
477 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  30.21 
 
 
477 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
477 aa  227  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
480 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.61 
 
 
480 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
480 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
397 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
480 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
480 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  29.61 
 
 
480 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.11 
 
 
468 aa  224  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.25 
 
 
477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 
554 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.19 
 
 
480 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.19 
 
 
483 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.11 
 
 
477 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
520 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
480 aa  216  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  28.9 
 
 
484 aa  207  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  36.66 
 
 
340 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  30.66 
 
 
480 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  31.78 
 
 
397 aa  205  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
481 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  30.02 
 
 
480 aa  203  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.02 
 
 
500 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  31.51 
 
 
480 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  30.39 
 
 
503 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  28.63 
 
 
480 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.94 
 
 
477 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  30.91 
 
 
485 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
477 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 
477 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  28.53 
 
 
463 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
478 aa  192  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  31.23 
 
 
425 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
468 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  29.42 
 
 
504 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  33.15 
 
 
401 aa  188  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09460  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  31.34 
 
 
404 aa  188  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
413 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1162  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 
479 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 
397 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 
436 aa  186  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  28.78 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 
468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 
377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.48 
 
 
501 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
473 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
406 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.21 
 
 
495 aa  182  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.7 
 
 
399 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 
521 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.03 
 
 
477 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
501 aa  182  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
501 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 
394 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  28.91 
 
 
501 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.35 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
482 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
480 aa  180  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1567  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
397 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 
402 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 
402 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
477 aa  179  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
482 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
482 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
482 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
470 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
397 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.71 
 
 
482 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 
461 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
504 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>