More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1857 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 468 aa  963    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 498 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 468 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 468 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.43 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  31.59 
 
 		 498 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  31 
 
 		 500 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.07 
 
 		 490 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  30.36 
 
 		 493 aa  232  8.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  30.35 
 
 		 484 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 480 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 480 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.33 
 
 		 480 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  31.39 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.68 
 
 		 483 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.13 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 480 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 395 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.19 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 450 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 479 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 477 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 477 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 402 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  32.41 
 
 		 406 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  30.35 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.46 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.35 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 477 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 477 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 477 aa  217  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 477 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  28.48 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  31.46 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  31.84 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.48 
 
 		 485 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 395 aa  209  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  28.9 
 
 		 482 aa  209  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 480 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 		 395 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 482 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 482 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 480 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  28.83 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  32.17 
 
 		 399 aa  206  1e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 398 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 482 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 398 aa  204  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  28.24 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 400 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.77 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 477 aa  203  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  28.54 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.87 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  27.74 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  29.98 
 
 		 477 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 477 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3055  putative transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  28.57 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>