More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2389 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  97.06 
 
 
482 aa  951    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  99.79 
 
 
482 aa  975    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
477 aa  978    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  99.79 
 
 
482 aa  975    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  97.27 
 
 
482 aa  954    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  94.97 
 
 
482 aa  937    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  99.79 
 
 
482 aa  975    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  95.81 
 
 
482 aa  947    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  99.79 
 
 
482 aa  975    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  95.6 
 
 
482 aa  940    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
519 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
520 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.78 
 
 
517 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
477 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
547 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  27.6 
 
 
478 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.46 
 
 
500 aa  226  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  29.32 
 
 
498 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 
395 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 
402 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  31.18 
 
 
402 aa  204  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 
520 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 
396 aa  203  7e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.99 
 
 
468 aa  203  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
397 aa  202  9e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  31.27 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  31.75 
 
 
395 aa  200  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.63 
 
 
503 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 
477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  31.94 
 
 
397 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
477 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 
377 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
383 aa  196  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  29.62 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 
401 aa  196  9e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
398 aa  196  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 
480 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
480 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  28.6 
 
 
478 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  29.4 
 
 
397 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
490 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  27.64 
 
 
480 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  27.2 
 
 
480 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
480 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  31.45 
 
 
402 aa  193  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 
480 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.07 
 
 
485 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
480 aa  193  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
480 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
480 aa  192  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.41 
 
 
480 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  29.94 
 
 
400 aa  192  9e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.72 
 
 
480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
480 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 
477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1924  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
468 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 
477 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  26.72 
 
 
480 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 
395 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2212  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
468 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  31.59 
 
 
395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  27.29 
 
 
480 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
395 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.35 
 
 
493 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
400 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  26.3 
 
 
483 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  29.62 
 
 
394 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5814  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
400 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
398 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 
394 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  29.28 
 
 
417 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.99 
 
 
477 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
393 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  28.07 
 
 
523 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0222  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.06 
 
 
464 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  27.53 
 
 
433 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.93 
 
 
477 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.08 
 
 
494 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
477 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
477 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6044  aminotransferase, class I and II  30.94 
 
 
400 aa  187  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
477 aa  186  8e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 
461 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 
481 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.42 
 
 
477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  29.4 
 
 
397 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.22 
 
 
477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
477 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  32.26 
 
 
406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>