More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1853 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  86.85 
 
 
481 aa  881    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  88.31 
 
 
480 aa  887    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  86.43 
 
 
480 aa  874    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  100 
 
 
480 aa  983    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  86.22 
 
 
480 aa  874    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  51.91 
 
 
477 aa  501  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  51.91 
 
 
477 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 
477 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  50.94 
 
 
485 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  51.39 
 
 
477 aa  496  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  51.51 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  51.2 
 
 
461 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  50.54 
 
 
503 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
476 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  53.24 
 
 
344 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  37.47 
 
 
477 aa  333  5e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  37.5 
 
 
477 aa  332  8e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  36.42 
 
 
477 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  36.84 
 
 
477 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  36.21 
 
 
477 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  36 
 
 
477 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  34.31 
 
 
480 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  33.82 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  33.61 
 
 
483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  33.61 
 
 
480 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
480 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
480 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
442 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  35.41 
 
 
442 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.98 
 
 
498 aa  256  5e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.74 
 
 
517 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
547 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  32.61 
 
 
478 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  27.22 
 
 
554 aa  228  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
477 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  27.88 
 
 
493 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.42 
 
 
490 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 
477 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  30.03 
 
 
397 aa  209  9e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
477 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
450 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
498 aa  206  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  30.67 
 
 
477 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
520 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
477 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
477 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
477 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
397 aa  205  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
477 aa  203  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 
377 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.54 
 
 
468 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
406 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  29.84 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.54 
 
 
480 aa  199  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
483 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  28.99 
 
 
397 aa  199  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 
436 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  28.69 
 
 
484 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  27.88 
 
 
463 aa  199  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3121  transcriptional regulator  26.95 
 
 
495 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.39 
 
 
517 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  30.73 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  29.58 
 
 
420 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  28.63 
 
 
479 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 
441 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  30.28 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
399 aa  196  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 
470 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
482 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
482 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
383 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
487 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
482 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  29.08 
 
 
437 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 
482 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
477 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0712  putative transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 
375 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0052998  normal  0.0161379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 
482 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.33 
 
 
492 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1049  putative GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
389 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
482 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
477 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 
611 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.56 
 
 
468 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2126  aminotransferase, class I and II  29.84 
 
 
386 aa  194  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.375573  normal  0.0326129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2148  aminotransferase, class I and II  29.84 
 
 
386 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  26.5 
 
 
477 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>