More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3789 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
477 aa  984    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  97.48 
 
 
477 aa  965    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  97.27 
 
 
477 aa  963    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  96.65 
 
 
477 aa  957    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  92.87 
 
 
477 aa  931    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  97.48 
 
 
477 aa  965    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  97.06 
 
 
477 aa  962    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  93.71 
 
 
477 aa  930    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  93.29 
 
 
477 aa  923    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  97.27 
 
 
477 aa  963    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
480 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2841  transcriptional regulator  51.37 
 
 
480 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.171165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2847  GntR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
480 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3058  transcriptional regulator, GntR family  50.95 
 
 
480 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3062  GntR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
480 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3074  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  51.16 
 
 
480 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2188  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  50.95 
 
 
483 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3093  GntR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
480 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0883302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2820  GntR family transcriptional regulator  50.95 
 
 
480 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3091  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  50.53 
 
 
480 aa  529  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  50.74 
 
 
480 aa  519  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 
480 aa  331  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  36.42 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
481 aa  326  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  35.64 
 
 
480 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  35.64 
 
 
480 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 
477 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  37.58 
 
 
477 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
478 aa  316  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  36.71 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  36.58 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  35.88 
 
 
477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  37.79 
 
 
503 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
476 aa  281  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2749  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 
477 aa  240  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2543  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 
477 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000100804 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  31.33 
 
 
493 aa  234  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2409  transcriptional regulator  30.53 
 
 
479 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00453228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.59 
 
 
517 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
395 aa  231  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2745  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  31.09 
 
 
477 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.59979e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2550  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
477 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2472  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
477 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.656755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2737  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
477 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 
397 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2506  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
477 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  30.02 
 
 
520 aa  226  9e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1451  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.25 
 
 
490 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2769  GntR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
477 aa  224  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000296805  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2487  GntR family transcriptional regulator C-terminal  37.24 
 
 
344 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
395 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 
397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
477 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 
437 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  32.02 
 
 
436 aa  216  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
492 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
340 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  30.04 
 
 
500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
547 aa  212  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
383 aa  213  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  29.59 
 
 
397 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
400 aa  209  9e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
395 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
498 aa  206  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.95 
 
 
482 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  28.78 
 
 
498 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 
386 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  29.58 
 
 
484 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
499 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  27.95 
 
 
478 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  29.79 
 
 
509 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
398 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 
611 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0615  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  28.91 
 
 
491 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736452  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0901  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 
554 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.21 
 
 
468 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
494 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0095  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0099  aminotransferase class I and II  29.84 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  33.43 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  28.69 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
480 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 
463 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
494 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  30.25 
 
 
495 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
494 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  30 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 
395 aa  197  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  28.43 
 
 
494 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.79 
 
 
487 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>