More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4302 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4302  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
521 aa  1048    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4437  GntR family transcriptional regulator  47.31 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7471  GntR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
449 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.650155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4138  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
470 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6053  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.14 
 
 
472 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137627  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2642  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
496 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0881  GntR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
478 aa  363  4e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426216  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2148  GntR family transcriptional regulator  42.34 
 
 
498 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1434  GntR family transcriptional regulator  43.82 
 
 
480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.515471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0559  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.77 
 
 
508 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2235  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.42 
 
 
473 aa  350  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1922  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
470 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.664628  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0573  GntR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
470 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3187  transcriptional regulator  42.41 
 
 
487 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.685376  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3314  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.84 
 
 
494 aa  342  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1191  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.91 
 
 
489 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.419241  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2912  transcriptional regulator, GntR family  34.66 
 
 
485 aa  327  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.784119  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0043  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0059  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.63 
 
 
487 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.869186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1025  GntR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.684124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3547  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.73 
 
 
477 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224357  normal  0.0204741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0047  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.67 
 
 
482 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.493151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2637  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.28 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4623  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.96 
 
 
489 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.609617  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2755  putative transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
456 aa  289  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.243959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3935  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
503 aa  273  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3373  transcriptional regulator  31.87 
 
 
484 aa  257  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.98747  normal  0.499869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
490 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  35.61 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
494 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 
494 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  35.88 
 
 
494 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
504 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  33.75 
 
 
475 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.45 
 
 
496 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.99 
 
 
485 aa  240  5e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  35.04 
 
 
495 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.27 
 
 
485 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4822  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
496 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364543  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  33.66 
 
 
504 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
496 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
547 aa  230  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  32.73 
 
 
509 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 
495 aa  229  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
509 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.4 
 
 
499 aa  226  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
477 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  32.49 
 
 
489 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  32.63 
 
 
499 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
509 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  30.51 
 
 
504 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
504 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  33.47 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
501 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.54 
 
 
488 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.09 
 
 
488 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  33.2 
 
 
570 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  32.04 
 
 
498 aa  217  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.97 
 
 
508 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
491 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
490 aa  216  8e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  33.4 
 
 
493 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.87 
 
 
490 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6846  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.42 
 
 
476 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  31.76 
 
 
508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.79 
 
 
495 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.61 
 
 
501 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.36 
 
 
515 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  32.02 
 
 
488 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 
496 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
477 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  29.25 
 
 
477 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
477 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
493 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.05 
 
 
477 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
477 aa  211  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  29.05 
 
 
477 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
475 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
485 aa  210  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  30.68 
 
 
521 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  32.56 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
477 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
520 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
506 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  30.31 
 
 
513 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
502 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
506 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
506 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
506 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
509 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
506 aa  207  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
473 aa  207  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
507 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>