More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1240 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1240  transcriptional regulator  100 
 
 		 478 aa  975    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0621  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0439  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  31.33 
 
 		 517 aa  248  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3297  hypothetical protein  33.9 
 
 		 493 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0920316 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1992  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 480 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0394003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1804  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 481 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2087  transcription regulator, GntR family  33.12 
 
 		 480 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000314762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3337  transcriptional regulator, GntR family  32.97 
 
 		 480 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  hitchhiker  0.0000000000000475852 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2708  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 477 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0205476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2175  GntR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 477 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1853  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 480 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.406204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2617  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000489907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 500 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2419  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 478 aa  227  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.926339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.87 
 
 		 498 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2434  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.523883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2355  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000240701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2609  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 482 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2389  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 477 aa  226  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2627  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0343754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2665  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 482 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.135654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0415  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2738  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000175529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2685  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116915 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2742  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.254452  hitchhiker  0.00000487111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2525  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0126099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2689  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 498 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00169618  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2581  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2449  transcription regulator GntR  28.94 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000025048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2469  transcriptional regulator  29.54 
 
 		 503 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0495293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.82 
 
 		 477 aa  210  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2693  transcriptional regulator, GntR family  29.75 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.686412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  28.17 
 
 		 477 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3767  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.73 
 
 		 477 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000429089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1442  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  28.6 
 
 		 477 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.057405  hitchhiker  0.00000201635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3600  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3886  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  207  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0775  GntR family transcriptional regulator with aminotransferase domain  31.38 
 
 		 484 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.835406  normal  0.904358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3499  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0033434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3799  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.29 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00124231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3789  GntR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0162684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3511  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  31.04 
 
 		 477 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  27.06 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1857  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.39 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.46 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.46 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  30.29 
 
 		 398 aa  196  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0356  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.716166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  26.88 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0347  GntR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 519 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.77 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  30.39 
 
 		 504 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2044  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 480 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.439116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  28.54 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 441 aa  191  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 398 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 487 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.98 
 
 		 471 aa  187  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 398 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 483 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3186  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.96 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.262075  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  30.28 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 377 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 396 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 450 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  29.3 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0466  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  30.23 
 
 		 480 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000195201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2027  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 383 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.97 
 
 		 393 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 473 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  28.73 
 
 		 474 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 532 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0780  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 494 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  29.33 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.77 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  28 
 
 		 404 aa  182  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.75 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 479 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2781  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4096  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0515  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  29.87 
 
 		 487 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.663704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  28.6 
 
 		 475 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>