More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2257 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 530 aa  839    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 479 aa  988    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  85.71 
 
 		 479 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  85.36 
 
 		 479 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  84.81 
 
 		 480 aa  839    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  86.92 
 
 		 479 aa  852    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  84.81 
 
 		 509 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  86.74 
 
 		 502 aa  835    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 479 aa  988    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  84.73 
 
 		 480 aa  842    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.82 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.53 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  40.47 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 477 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 469 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  39.4 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 473 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 469 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  39.35 
 
 		 470 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.13 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 470 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 491 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 496 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.66 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 477 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 474 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  39.32 
 
 		 496 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  39.41 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 471 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.31 
 
 		 470 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 478 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 473 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.95 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.74 
 
 		 479 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  38.63 
 
 		 473 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  38.58 
 
 		 471 aa  352  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 469 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.7 
 
 		 473 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 473 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 483 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 469 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.51 
 
 		 498 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 469 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 470 aa  345  8.999999999999999e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.69 
 
 		 475 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.83 
 
 		 474 aa  345  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0076  transcriptional regulator  40.47 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.83 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  38 
 
 		 482 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.56 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 473 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 532 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  34.4 
 
 		 475 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 484 aa  342  9e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  39.57 
 
 		 472 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 473 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.03 
 
 		 475 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.97 
 
 		 486 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 473 aa  340  5e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  36.58 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 478 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 473 aa  339  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 504 aa  339  5.9999999999999996e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.77 
 
 		 483 aa  338  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  38.92 
 
 		 479 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 472 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.54 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.76 
 
 		 474 aa  335  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  35.94 
 
 		 475 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.9 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.33 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>