More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4810 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 474 aa  980    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  53.63 
 
 		 471 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 473 aa  521  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.72 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.47 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.97 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 469 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 478 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 480 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  37.77 
 
 		 500 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.4 
 
 		 492 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 482 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 487 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 483 aa  356  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 475 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.63 
 
 		 470 aa  353  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 477 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40 
 
 		 472 aa  351  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 532 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 483 aa  345  8.999999999999999e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 470 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 473 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 479 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.33 
 
 		 475 aa  339  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.06 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  36.64 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 491 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 479 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 479 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 489 aa  333  4e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 477 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 471 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 504 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  37.87 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  35.97 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  39.03 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 476 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  35.74 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.03 
 
 		 479 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  34.46 
 
 		 473 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 473 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 479 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 477 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.89 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 477 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 477 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.47 
 
 		 475 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 496 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  36.17 
 
 		 474 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  35.71 
 
 		 472 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.38 
 
 		 484 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  35.32 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 474 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 472 aa  315  8e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 474 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.31 
 
 		 498 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 474 aa  315  9e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 530 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 500 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.96 
 
 		 471 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.55 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  35.26 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 474 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>