More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0145 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0145  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
472 aa  979    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  62.13 
 
 
471 aa  662    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.4 
 
 
474 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  48.02 
 
 
473 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.03 
 
 
475 aa  465  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.88 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.35 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.93 
 
 
479 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
478 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
487 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  41.72 
 
 
500 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
471 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
482 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  40.65 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  41.08 
 
 
472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
477 aa  360  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.01 
 
 
472 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  38.64 
 
 
483 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  39.78 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
477 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
469 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
469 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.06 
 
 
480 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
491 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 
473 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  39.96 
 
 
473 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.23 
 
 
470 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
469 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.46 
 
 
492 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
470 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
483 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
532 aa  344  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  38.35 
 
 
477 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  38.11 
 
 
477 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 
477 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
472 aa  339  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  39.27 
 
 
493 aa  338  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
477 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
477 aa  338  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
470 aa  338  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
479 aa  336  7e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
477 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.46 
 
 
477 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.63 
 
 
487 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  38.3 
 
 
473 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
475 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
477 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  37.95 
 
 
481 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1173  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.23 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.914694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  36.4 
 
 
473 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
476 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
473 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  37.84 
 
 
483 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
478 aa  326  5e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 
473 aa  326  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 
471 aa  326  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  35.85 
 
 
473 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
473 aa  325  9e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.56 
 
 
472 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
473 aa  325  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
489 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.25 
 
 
484 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
473 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  35.17 
 
 
475 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 
474 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.56 
 
 
471 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  35.67 
 
 
478 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
474 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
504 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  37.12 
 
 
479 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  35.91 
 
 
473 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
478 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
478 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  36.03 
 
 
473 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
473 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  37.58 
 
 
482 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.26 
 
 
477 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
496 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
496 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
473 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  35.73 
 
 
477 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  36.03 
 
 
478 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  36.67 
 
 
474 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3105  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.45 
 
 
486 aa  317  4e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.41 
 
 
483 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
474 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  36.46 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.84 
 
 
474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>