More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2175 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 500 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 498 aa  1011    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  58.55 
 
 		 477 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  53.28 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1471  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  52.27 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.352994  normal  0.0159158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 480 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.81 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 473 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 482 aa  359  7e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  38.03 
 
 		 475 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 483 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.2 
 
 		 479 aa  349  5e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 476 aa  348  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 532 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.77 
 
 		 477 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  38.88 
 
 		 500 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 473 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.51 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 470 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.29 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 478 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  38.59 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 472 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 472 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 472 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 472 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.59 
 
 		 470 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 472 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  342  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  37.69 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.32 
 
 		 484 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  36.93 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 475 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 475 aa  340  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  37.53 
 
 		 474 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 478 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.61 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 475 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 474 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  36.89 
 
 		 474 aa  335  9e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 471 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.91 
 
 		 487 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.26 
 
 		 474 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 470 aa  333  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 475 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 477 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 477 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 477 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  38.88 
 
 		 472 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 		 475 aa  326  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  39.4 
 
 		 477 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 483 aa  323  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 491 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 493 aa  324  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 479 aa  323  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 491 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  39.31 
 
 		 472 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  41.7 
 
 		 482 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 491 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 480 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  37.15 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>