More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5419 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  69.15 
 
 
473 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  97.67 
 
 
474 aa  934    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  96.18 
 
 
474 aa  922    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  100 
 
 
474 aa  976    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  71.06 
 
 
472 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  71.28 
 
 
472 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  95.75 
 
 
475 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  71.28 
 
 
472 aa  680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  71.28 
 
 
472 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  95.14 
 
 
474 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  95.75 
 
 
474 aa  919    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  69.08 
 
 
479 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  70.85 
 
 
493 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  96.39 
 
 
474 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  96.38 
 
 
474 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  69 
 
 
473 aa  670    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  69 
 
 
473 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  70.85 
 
 
532 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  69.85 
 
 
478 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  66.6 
 
 
477 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  66.53 
 
 
477 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  81.95 
 
 
474 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
475 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  94.93 
 
 
474 aa  914    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  96.18 
 
 
474 aa  921    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  71.28 
 
 
472 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  68.72 
 
 
478 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  68.63 
 
 
473 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  74.52 
 
 
475 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  95.52 
 
 
474 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  95.54 
 
 
475 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  81.74 
 
 
475 aa  815    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
473 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  96.18 
 
 
474 aa  921    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  94.93 
 
 
474 aa  914    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  71.06 
 
 
472 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  53.08 
 
 
478 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  49.36 
 
 
487 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  49.04 
 
 
469 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  48.73 
 
 
500 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
471 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  49.16 
 
 
482 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  48.62 
 
 
469 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  47.98 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  48.63 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  48.31 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
473 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  45.97 
 
 
478 aa  438  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
477 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
476 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.15 
 
 
470 aa  429  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 
491 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  46.45 
 
 
489 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.37 
 
 
480 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.37 
 
 
492 aa  425  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  44.82 
 
 
473 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.82 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  46.92 
 
 
481 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  45.11 
 
 
477 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  44.89 
 
 
477 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
477 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  45.11 
 
 
477 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  44.07 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.14 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  44.54 
 
 
483 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.83 
 
 
483 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  43.71 
 
 
471 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  44.16 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.92 
 
 
483 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.45 
 
 
473 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
470 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.54 
 
 
483 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 
479 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  43.95 
 
 
477 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  42.8 
 
 
470 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.98 
 
 
472 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
483 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  41.76 
 
 
483 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.31 
 
 
470 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  41.88 
 
 
470 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  42.55 
 
 
483 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  45.61 
 
 
482 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  43.95 
 
 
479 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
470 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.88 
 
 
472 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  40.55 
 
 
468 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
469 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2207  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.59 
 
 
468 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
493 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
493 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
491 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  41.24 
 
 
474 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
473 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
493 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
471 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>