More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6190 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  82.53 
 
 		 474 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 472 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  66.03 
 
 		 477 aa  658    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  82.03 
 
 		 474 aa  805    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  82.88 
 
 		 475 aa  812    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  81.74 
 
 		 474 aa  797    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  67.87 
 
 		 479 aa  669    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  69.92 
 
 		 493 aa  681    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  82.53 
 
 		 474 aa  811    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 474 aa  802    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  71.37 
 
 		 475 aa  718    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  68.57 
 
 		 473 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 475 aa  981    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  69.62 
 
 		 473 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 472 aa  683    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 532 aa  697    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  64.52 
 
 		 477 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  89.45 
 
 		 474 aa  892    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  81.18 
 
 		 474 aa  801    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  67.3 
 
 		 475 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 474 aa  806    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  83.37 
 
 		 474 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  68.58 
 
 		 478 aa  668    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  69.47 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  69.62 
 
 		 473 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  81.18 
 
 		 474 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 475 aa  807    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  83.37 
 
 		 474 aa  819    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  68.35 
 
 		 473 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  83.37 
 
 		 474 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  82.24 
 
 		 474 aa  806    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  68.35 
 
 		 473 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  68.58 
 
 		 478 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  48.2 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  46.72 
 
 		 500 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  47.02 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  44.8 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 469 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.38 
 
 		 484 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 469 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 473 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.61 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.14 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.61 
 
 		 492 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.78 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  46.6 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  43.74 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 477 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 477 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  44.1 
 
 		 483 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  43.74 
 
 		 477 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  42.8 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 491 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 479 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  45.53 
 
 		 482 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 483 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.98 
 
 		 483 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.56 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.21 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  42.16 
 
 		 472 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  41.14 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1437  GntR family transcriptional regulator  41.68 
 
 		 494 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0527  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0626  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1243  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.396682  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1468  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3050  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 473 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 470 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.34 
 
 		 472 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1569  GntR family transcriptional regulator  41.65 
 
 		 491 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.09 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.51 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  42.02 
 
 		 478 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  39.24 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>