More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5696 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  82.24 
 
 		 475 aa  825    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  69.92 
 
 		 473 aa  681    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  97.68 
 
 		 474 aa  941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  94.93 
 
 		 474 aa  914    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  95.54 
 
 		 474 aa  917    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  70.46 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  70.46 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  70.46 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  73.25 
 
 		 475 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 479 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  70.04 
 
 		 493 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6410  transcriptional regulator  95.35 
 
 		 474 aa  923    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.267118  normal  0.167167 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  96.84 
 
 		 474 aa  933    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7006  GntR family transcriptional regulator  94.93 
 
 		 474 aa  914    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  99.37 
 
 		 475 aa  975    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  69.56 
 
 		 473 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 472 aa  681    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  70.46 
 
 		 532 aa  699    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  96.2 
 
 		 474 aa  929    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 477 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  70.46 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  81.61 
 
 		 474 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  70.19 
 
 		 478 aa  683    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 475 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1399  GntR family transcriptional regulator  94.71 
 
 		 474 aa  913    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  97.47 
 
 		 474 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  69.28 
 
 		 478 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  70.25 
 
 		 472 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 473 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5662  GntR family transcriptional regulator  95.56 
 
 		 474 aa  925    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 475 aa  980    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  69.49 
 
 		 473 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  69.49 
 
 		 473 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  97.47 
 
 		 474 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6430  GntR family transcriptional regulator  94.71 
 
 		 474 aa  913    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  66.53 
 
 		 477 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0336  GntR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  47.56 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  47.98 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 470 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  47.13 
 
 		 469 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1892  GntR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 477 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 478 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4651  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.36 
 
 		 484 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.78 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2093  GntR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132381  normal  0.73636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46.15 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0752  GntR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.743264  normal  0.0151878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  44.03 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.51 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  45.15 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  45.63 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.92 
 
 		 471 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.52 
 
 		 483 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 477 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  43.91 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3087  transcriptional regulator GntR  42.8 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  43.92 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  42.28 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.23 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 483 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.19 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  42.31 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 470 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  41.88 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0726  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 482 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  43.62 
 
 		 479 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  39.57 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  41.24 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  41.24 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  41.24 
 
 		 474 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 475 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>